O odor das fezes está principalmente ligado a processos de putrefação que afetam os aminoácidos que escapam da absorção intestinal. Esses nutrientes são de fato interceptados pelas bactérias do cólon, passando por um processo de descarboxilação que produz as seguintes aminas tóxicas:
arginina → agmatina
cistina e cisteína → mercaptano
histidina → histamina
lisina → cadaverina
ornitina → putrescina
tirosina → tiratina
triptofano → indol e escatol
Muitas dessas substâncias dão às fezes um odor particularmente desagradável. As fezes tornam-se bastante malcheirosas mesmo quando permanecem no intestino por muito tempo, bem como nos casos de má absorção mencionados anteriormente (doença celíaca, insuficiência pancreática, infecções intestinais, doença de Crohn, colite ulcerativa, síndrome do intestino curto, fibrose cística, fígado doença e vias biliares e doenças gástricas acompanhadas de hipocloridria). Quando a má absorção é principalmente de proteína, o cheiro das fezes é nauseante, enquanto se torna acre e penetrante quando grandes quantidades de açúcares e amidos não absorvidos ou mal digeridos chegam ao cólon, depois fermentados pela flora local com a produção de ácidos graxos voláteis .
A diarreia e as fezes do vegetariano cheiram mal.
As fezes com cheiro de peixe ou esperma são características da disenteria bacilar, cólera e, mais geralmente, da mucorreia.
Em resumo, o cheiro das fezes é, portanto, influenciado pelos hábitos alimentares (quantidade de proteínas, alimentos aromáticos como alho ou cebola, etc.), pela flora bacteriana intestinal, pelo estado de saúde e por hábitos específicos (como fumar ou mastigar tabaco). Em geral, o consumo de refeições pequenas e bem balanceadas, sem associar grandes quantidades de alimentos "incompatíveis" (ver dieta dissociada), ajuda a otimizar os processos digestivos, reduzindo a incidência de distúrbios como meteorismo e flatulência, e conferindo a fezes com cheiro sui generis.
Qualquer caso em que o mau odor das fezes seja acompanhado de sintomas como fezes pretas, alcatroadas ou claras, presença de sangue nas mesmas, febre, calafrios, cólicas abdominais intensas, presença abundante de muco nas fezes e perda de peso.
