É importante distinguir a diarreia aguda da crônica, localizar o problema no intestino delgado ou grosso e entender se a diarreia é devido a uma doença gastrointestinal primária ou se é uma consequência de uma doença extra-intestinal.
Considerando as várias causas da diarreia e seu caráter potencialmente autolimitante, a abordagem diagnóstica deve variar de acordo com a história clínica do paciente, gravidade dos sintomas e disponibilidade do proprietário.
são as causas mais comuns. Nestes casos, a anamnese é muito importante (contato com animais doentes, intolerâncias conhecidas, permanência em canis, consumo de comida mal passada ou estragada). A presença de muco, sangue vivo, dificuldade e urgência em defecar são indicativos de problema de intestino grosso , enquanto a perda de peso e sangue digerido indicam envolvimento do intestino delgado.
Para animais com diarreia leve, consumo normal de comida e água, sem vômitos ou desidratação, os cuidados de suporte são geralmente suficientes. Em caso de progressão dos sinais clínicos, com desidratação e perda de apetite, são necessários exames diagnósticos complementares como exames de fezes, exames de doenças infecciosas e exames de sangue, com atenção especial aos animais com sinais de doenças sistêmicas.
A diarreia em animais de companhia tem sido relacionada com Clostridium perfringens, Clostridium difficile, Campylobacter, Salmonella e E. coli. Por outro lado, no entanto, muitos animais saudáveis abrigam essas bactérias, e seu achado não implica necessariamente a presença de sinais clínicos.
Em particular, há uma correlação aparente entre C. perfringens e diarreia hemorrágica aguda, mas não está claro se a presença desta bactéria é causa ou consequência, devido a uma "alteração na microflora intestinal; o mesmo vale para C. difícil.
O Campylobacter, por outro lado, é capaz de causar sintomas gastrointestinais principalmente em animais jovens expostos a fatores predisponentes como estresse, superlotação e doenças concomitantes.
Alguns tipos de E. coli podem causar infecções intestinais em cães com sistema imunológico debilitado e estão frequentemente envolvidos na colite granulomatosa de Boxer, com lesões semelhantes também descritas no Bulldog Francês e Border collie.