São principalmente tubulares ou ovóides. São delimitados por uma membrana externa semelhante à celular; no interior, separada por um espaço de cerca de 60-80 A, há uma segunda membrana que se introflete em cristas, circunscrevendo um espaço ocupado pela matriz mitocondrial. A membrana interna possui um tipo de partículas chamadas partículas elementares, nas quais as enzimas da respiração estão organizadas em uma série ordenada (a fosforilação oxidativa ocorre na mitocôndria).
As mitocôndrias são aquelas organelas onde a maior parte do ATP das células eucarióticas é produzida e estão presentes em quase todos os tipos de células vegetais e animais. Esses processos dinâmicos ocorrem por meio do transporte de metabólitos e elétrons, em partículas elementares, de uma enzima para outra, com uma transferência gradual de energia.
As mitocôndrias contêm DNA, RNA e ribossomos mitocondriais.
Se considerarmos as mitocôndrias como microorganismos que metabolizam os catabólitos da célula hospedeira, e em particular aqueles fragmentos nos quais a molécula de glicose foi dividida na fase anaeróbia citoplasmática de sua demolição, veremos que a mitocôndria tenderá a se aglomerar e multiplicar bem onde o seu alimento é mais abundante, ou seja, onde a demolição da glicose, devido à maior demanda de energia, é mais intensa. Em particular, nos músculos as mitocôndrias estão alinhadas ao longo dos feixes de fibras, e seu número e volume aumentam com a demanda, ou seja, com o treinamento.
O facto de as mitocôndrias serem dotadas de património hereditário próprio, de reprodução autónoma, etc., sugere o facto de também elas poderem apresentar uma certa variabilidade, ainda que limitada, e este conceito é estudado como um dos componentes da eficiência. .
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