. No diafragma existem várias aberturas que permitem a passagem de vasos, nervos e outras estruturas, que vão da cavidade torácica à cavidade abdominal e vice-versa. Uma dessas aberturas, chamada de hiato esofágico, permite a passagem do esôfago.
Na hérnia deslizante, a parte do estômago que sobe para o tórax é a passagem entre o esôfago e o estômago; essa região de fronteira é chamada de junção gastroesofágica ou cárdia. Uma vez que a cárdia sobe para cima, não sendo mais comprimida pelo hiato e sofrendo um desalinhamento em relação à sua posição natural, ela perde sua função. Consequentemente, a cárdia não é mais capaz de impedir com eficácia o conteúdo ácido do estômago para o esôfago, resultando em refluxo gastroesofágico, um distúrbio típico da doença.